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微波烘干机在对食品进行杀菌时，微波能与食品内的细菌发生作用，对细菌膜断面的电位分布影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢，生长发育受阻碍死亡。从生化角度来看，细菌正常生长和繁殖的核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）是由若干氢键紧密连接而成的卷曲大分子，微波导致氢键松弛、断裂和重组，从而诱发遗传基因或染色体畸变，甚至断裂。微波杀菌正是利用电磁场效应和生物效应起到对微生物的杀灭作用。
微波灭菌机食品在生产、保存、运输和销售过程中非常容易污染变质。通常可以采用高温、干燥、烫漂、巴氏灭菌、冷冻以及防腐剂等常规技术来实现对食品的杀虫灭菌与保鲜，但往往影响食品的原有风味和营养成分。
而微波干燥灭菌机是使食品中的微生物，同时受到微波热效应与非热效应的共同作用，使其体内蛋白质和生理活动物质发生变异，而导致微生物体生长发育延缓和死亡，达到食品灭菌、保鲜的目的。
隧道式微波干燥灭菌机是一种满足大批量生产的干燥设备，能够对粉状、药丸、颗粒状、片状或胶体状等食品、调味品、药品、中药材、方便面、米粉、豆制品、猪牛肉、海鲜、茶叶、木材、化工、饮片等物料进行干燥脱水、灭菌、熟化、杀青、杀虫卵等功效。
